BIOINFORMATICA - 455551
- Descripción :
La asignatura esta orientada a estudiantes con conocimientos en biologia molecular, genetica y estadistica, pero con poca experiencia en el manejo de recursos computacionales. Los alumnos, al final del curso aplicaran herramientas bioinformaticas en para el analisis de secuencias de acidos nucleicos y proteinas empleando algoritmos y programas computacionales. Ademas el curso introduce al alumno conceptos generales para la planificacion de metodos y estrategias de analisis de datos masivos obtenidos por secuenciacion de segunda generacion.
Esta asignatura contribuye al logro de las siguientes competencias del perfil de egreso del Ingeniero en Biotecnologia Vegetal:
- Analizar procesos biologicos en especies vegetales, para la generacion de nuevos conocimientos y tecnologias, contribuyendo al desarrollo social con compromiso etico.
- Usar herramientas computacionales para analizar y sintetizar datos masivos relacionados con procesos biologicos y biotecnologicos.
- Comunicar ante sus pares resultados en forma oral y/o escrita tanto en castellano como en ingles.
- Integrar equipos de trabajo interdisciplinarios en diversos contextos.
- Resultados aprendizaje esperados :
R1. Seleccionar y aplicar tecnologias para el estudio de distintos procesos biologicos en especies vegetales.
R2. Reconocer y aplicar criterios de busqueda en bases de datos locales y de acceso remoto.
R3. Seleccionar y aplicar los programas elementales de Bioinformatica para dise?ar partidores, sondas, alinear secuencias y generar modelos de prediccion.
R4. Aplicar criterios de dise?o, seleccion y analisis de marcadores moleculares.
R5. Reconocer y planificar metodos y estrategias de analisis de datos masivos obtenidos por secuenciacion de segunda generacion (Next generation sequencing, NGS).
R6. Leer comprensivamente textos en ingles.
R7. Utilizar la comunicacion no verbal para complementar y enriquecer sus presentaciones.
R8. Planificar las actividades y distribuir roles y responsabilidades.
- Contenidos :
1. Introduccion a la Bioinformatica.
2. Generacion, coleccion y almacenamiento de datos en el Laboratorio.
3. Metodos de programacion dinamica para alineamiento de secuencias biologicas: algoritmos global, local y semiglobal.
4. Alineamiento de pares de secuencias.
5. Alineamiento multiple de secuencias.
6. Prediccion de la estructura secundaria de secuencias de ARN y proteinas.
7. Dise?o y analisis de marcadores moleculares.
8. Analisis de diversidad genetica con marcadores moleculares.
9. Analisis filogenetico.
10. Analisis de marcadores moleculares para certificacion clonal.
- Metodología :
Clases lectivas, laboratorios experimentales, trabajo colaborativo, unidad experimental, lectura de articulos de investigacion.
- Evaluación :
Certamenes, informes escritos, exposiciones oral.
- Facultad :ESCUELA DE CIENCIAS Y TECNOLOGIAS
- Departamento :DEPTO. DE CS. Y TECNOLOGIA VEGETAL
- Creditos :3
- Cupos :6
- Campus :LOS ANGELES